Glyngøre Havn er en aktiv havn med hjemsted både for erhvervsfiskere, lystsejlende og sportsdykkere. Havnen er opdelt i to sektioner, henholdsvis lystbådehavnen og fiskerihavnen. Lystbådehavnen ligger smukt ud til Sallingsund sammen med den travle fiskerihavn, hvor der landes muslinger, østers og forskellige slags fisk. Ved siden af lystbådehavnen findes en dejlig badestrand, hvor Det Blå Flag vejer. Syd for havnen findes den nye dykkerpark, som blev indviet i 2013. Lystbådehavnen har ca. 100 pladser og er meget populær som mål for sejlere både fra lokale limfjordshavne og fra udenbys havne. Havnen er medlem af Frihavnsordningen. Klubhuset er til rådighed for gæstesejlere. Her findes bad og køkkenfaciliteter.